Homeworld: Cataclysm снова вернёт нас к историческому конфликту расы, искавшей свой родной дом в бесконечной вселенной, оригинальным боям в условиях вакуума и невесомости, а также раскроет некоторые секреты игровой вселенной.
Великий Исход завершился обретением родины и разгромом милитаристичной Тайданской Империи. Все понемногу налаживается и спустя несколько десятилетий жизнь постепенно возвращается в мирное русло. Но корабль рудокопов становится свидетелем того, как исследователи подвергаются атаке неизвестной биологической сущности, которая чуть позже перекидывается на пиратов, крутившихся неподалёку. Сбежать удаётся с большими потерями, но Тварь идёт по следу, атакуя любой корабль и присоединяя его к себе. Дальнейшие события показывают – остатки империалистических реваншистов заигрались с образцами древней ДНК и выпустили демона на свободу. Более того – они не собираются сворачивать эксперименты, а видят в чудовищном биологическом объекте оружие, способное уничтожить кушан и восстановить Империю. Кушане понимают опасность, скрытую в этой мерзости и принимают решение окончательно уничтожить остатки имперского флота и инфраструктуры.