MDK 2 продолжает историю безумно-гениального учёного, тренированного уборщика-спасателя и спецсобаки-киборга, которые противостоят космической угрозе.
После разгрома первой волны вторжения, уборщик заявляет, что хочет вернуться к своим прямым обязанностям – сражаться с пришельцами оказалось хлопотным и утомительным делом. Однако к земле движется очередной майнкраулер, который уборщик решает уничтожить по-быстрому – и попадает в заготовленную ловушку. Доктор отправляет ему на помощь вооружённую до зубов спецсобаку, Курту удаётся сбежать и, наконец, добраться до своего мощного костюма. Пришельцы в панике пытаются остановить уборщика, вошедшего в боевой раж, но все попытки безуспешны. Захватчики пытаются заминировать корабль, но ударная команда по защите земли успевает получить координаты домашнего мира инопланетян. Приходит время ответного удара, который обезопасит нашу планету от угрозы раз и навсегда. Совершенно безбашенное действо, которое закончится штурмом императорского дворца на планете хозяев майнкраулеров и бесславной гибелью императора.